La Confederació Hidrogràfica de l’Ebre nega que hagi posat traves en la reducció del cabal del riu per poder realitzar els mostrejos o tractaments contra la mosca negra. Després de la crítiques del COPATE i alcaldes, la CHE ha emès un comunicat on assegura que ha ofert en tot moment col·laboració per coordinar, junt amb les hidroelèctriques, la maniobra per reduir els cabals de tram final del riu.
També assenyalen que la CHE “mai ha negat peticions” rebudes per la delegació del Govern a les Terres de l’Ebre per realitzar les oportunes maniobres als embassaments. Amb tot, la CHE deixa clar que quan es registren elevats volums d’aigua als embassaments o al riu, com ha passat ara amb el pantà de Mequinensa, es demana retardar els tractaments per tal de garantir la seguretat de les poblacions riberenques.